Sebészeti és Molekuláris Patológiai Osztály

Sebészeti és molekuláris patológiai diagnosztikus tevékenység

A Daganatpatológiai Központ fő feladata a daganatok citológiai, szövettani és molekuláris diagnosztikája mellett a célzott terápiákhoz szükséges prediktív molekuláris genetikai eltérések vizsgálata.

A Sebészeti és Molekuláris Patológiai Osztály évente 60-80 autopsziát végez, 13-14 ezer sebészeti mintát dolgoz fel, amelyek többsége emlő, bőr, gyomor-bél rendszer, fej-nyaki, nyirokcsomó, női és férfi urogenitális traktus és tüdő daganat. Hozzávetőleg 6- 800 konzultációs vizsgálatot végez, ami részben az intézetben kezelésre kerülő betegek anyagának másodvéleményezése, részben patológus kollégák által küldött diagnosztikus nehézséget okozó esetek vizsgálata. A központban működő immunhisztokémiai labor évente 30 ezer immunhisztokémiai reakciót végez a rendelkezésre álló 170 féle különböző reagenssel.

A főigazgató döntése alapján 2013-ban Magyarországon elsőként bevezetésre került a Vantage minőségbiztosítási rendszer, egy olyan laboratóriumi informatikai rendszer, ami átláthatóvá és ellenőrizhetővé teszi a patológiai laboratóriumban zajló munkafolyamatokat, jelentősen növelve a betegbiztonságot. A leletezés belső protokollok szerint, prognosztikai patológiai lelet (sablonizált) formában történik.

A molekuláris patológia laboratórium a vizsgálatok széles spektrumát végzi döntően szolid tumorok (tüdő-, vastagbél-, lágyrész-, emlő, nyirokcsomó daganatok, melanoma) esetén, évente 3000 vizsgálat történik. Az országban elsőként vezettük be méhnyak, és fej-nyaki daganatokban a humán papilloma vírus kimutatását. A vizsgálatok döntő többsége DNS alapú. A minták típusa legtöbbször formalin fixált vagy mélyfagyasztott anyag. Rutinszerűen alkalmazzuk az un. “liquid based”, elsősorban vérből történő vizsgálatot célzott terápiák alapjául szolgáló genetikai eltérések vizsgálatára. Jelenleg intézetünkben a jól szervezett, megbízhatóan működő diagnosztikus munka eredményeként egy nemzetközi szinten is nagy anyagmennyiséggel dolgozó molekuláris patológiai laboratórium működik, ami a költséghatékonyság és minőségbiztosítás szempontjából egyaránt legideálisabb feltételeknek megfelelő. A növekvő mintaszám és az egyre nagyobb számú mutáció vizsgálatának igénye miatt elengedhetetlenné vált az új generációs szekvenálás bevezetése a rutin molekuláris patológiai diagnosztikába is. Országosan elsők között vezettük be a solid tumorok molekuláris patológiai diagnosztikájába („Ion GeneStudio S5” genom szekvenáló készülék). A módszer a betegek mintájából nagyszámú gén egyidejű vizsgálatára nyújt lehetőséget.

Az osztályon rutinszerűen végzett molekuláris diagnosztikai vizsgálatok

Tüdő adenocarcinoma: EGFR 18, 19, 20 (T790M), 21 exon; KRAS, NRAS 2,3,4 exon; BRAF 11, 15 exon; ALK transzlokáció; ROS1 transzlokáció; PDL-1 immunhisztokémia: DAKO 22C3, Ventana SP263; Her-2 amplifikáció; MET amplifikáció;
Vastagbél adenocarcinoma: Kiterjesztett RAS mutáció (KRAS, NRAS 2,3,4 exon); BRAF 15 exon; Microsatellita instabilitás; EGFR IH (confirm anti-EGFR 5B7); Her-2 amplifikáció;
Melanoma: BRAF 15 exon; NRAS 2,3,4 exon; c-kit;
GIST: c-kit 9, 11 exon; PDGFRa 12, 18 exon;
Non-Hodgkin lymphoma: IgH génátrendeződés; TCR gamma lánc génátrendeződés; bcl-2; bcl-6; c-myc transzlokáció
Urothelialis panel:PDL-1 immunhisztokémia: Ventana SP142, Ventana SP263, DAKO 22C3; MSI;
Ovarium carcinoma: BRCA1-2;
HPV kimutatás;
Fluorescens és chromogen in situ hibridizáció: emlő- és gyomor daganatokban terápiás molekuláris célpont analízisére (Her2 amplifikáció), lágyrész sarcomákban diagnosztikus célú transzlokációs vizsgálatok, EBER chromogen in situ hybridisatio EBV fertőzés kimutatására;

Dr. Szőke János és Dr. Tóth Erika vezetése alatt a Központban három területen újabb nagy fejlődés valósult meg. Ezek a következők:

1. Strukturált leletezés bevezetése elsőként az országban. Ennek előnye a standard leletformátum és minden szükséges patológiai információ a klinikum számára.
2. Elsőként az országban laboratóriumi informatikai rendszer telepítése, amely a jelentősen megnövekedett eset- és metszetszám mellett is biztosította a szövettani feldolgozás minden lépésének pontos dokumentálhatóságát, a dolgozók teljesítményének és a beérkezett anyagmennyiségnek a monitorozását, és jelentősen növelte a betegbiztonságot.
3. A patológiai diagnosztikához és személyre szabott daganatellenes kezeléshez szükséges molekuláris biológiai eljárások meghonosítása és alkalmazása.

A Sebészeti és Molekuláris Patológiai Osztályon asszisztens, biológus, admisztratív munkakörben tevékenykedő munkatárs, rezidens és szakorvos dolgozik.

Tudományos tevékenység

A Sebészeti és Molekuláris Patológiai Osztály keretén belül működik a Tumorbiológiai laboratórium dr. Ladányi Andrea biológus (PhD) vezetésével. A laboratórium fő kutatási iránya a gazdaszervezet daganatprogresszióban játszott szerepének tanulmányozása, ezen belül is elsősorban a tumort infiltráló immunsejtek prognosztikus és prediktív értékének vizsgálata. A kutatások PhD-hallgatók bevonásával folynak, szoros együttműködésben az osztály patológusaival, valamint az intézet betegellátó (pl. Onkodermatológiai Osztály, Fej-nyaki Daganatok Multidiszciplináris Központ), ill. kutató osztályaival (pl. Kísérletes Farmakológiai Osztály).
További kutatási irányvonalak diagnosztikusan orientáltak a gyakoribb daganatféleségek prognosztikus és/ vagy prediktív markereinek vizsgálatára.

Belföldi lapokban megjelent cikkek száma 2018-ban: 4
Nemzetközi folyóiratokban megjelent cikkek száma 2018-ban: 9
Összesített impakt faktor 2018-ban: 35,991