
ONKOLÓGIAI KUTATÓ KÖZPONT
MOLEKULÁRIS IMMUNOLÓGIA ÉS TOXIKOLÓGIA OSZTÁLY (MITO)

Betegellátás
Osztályunkon túlnyomó részt kutatómunka folyik, azonban diagnosztikai célú méréseket is végzünk:
- Farmakokinetikai célból és a mellékhatások előrejelzésére mérjük a methotrexat koncentrációját a daganatos betegek vérplazmájában.
- Jelenleg kísérleti fázisban van különböző tumor és biológiai markerek meghatározása, amelyeket validálás után szeretnénk beilleszteni a diagnosztikába és a betegellátásba.
Kutatási terület
A 2011-ben alakult Molekuláris Immunológia és Toxikológia Osztály kutatási területei új irányvonalat képviselnek az Országos Onkológiai Intézetben. Kutatásaink alapmotívuma a szabadgyökök és reaktív oxidáló/redukáló szerek tumorbiológiai szerepeinek a vizsgálata. Kutatásaink középpontjában a Reaktív Oxigén Származékok (ROS) és Reaktív Kén Származékok (RSS) oxidatív stresszben (pl. kemo- vagy sugárterápia-indukált) és redoxivezérelt sejten belüli jelátviteli folyamatokban (terápiás célpontok azonosítása és rezisztencia útvonalak feltérképezése kapcsán) betöltött szerepei állnak.
A hagyományos kemoterápiával szemben a célzott terápiákat a daganatsejtek specifikus elpusztítására tervezik, azok molekuláris sajátosságait kiaknázva. Elterjedt nézet, hogy a fehérje-fehérje kölcsönhatások útján képződő funkcionális poszttranszlációs módosulatok központi szerepet játszanak a daganatsejtek onko-jelátviteli folyamataiban. A foszforilációs kaszkádokon túl, mára már széles körben elfogadott, hogy az oxidáció-indukált módosulatok is fontos jelátvitel szabályzók.
A malignus sejtek az egészségesekhez képest túltermelik a ROS és RSS molekulákat. Továbbá, a redoxi-egyensúly fenntartására overexpresszálják az antioxidáns enzimeket és kismolekulákat is. A megnövelt ROS és RSS fluxus azt sugallja, hogy a redoxivezérelt jelátviteli folyamatok módosulása megkülönböztető tulajdonság lehet a daganatsejtek biológiájában, ezért új terápiás célpontok azonosítására adhat lehetőséget. Ez az újszerű megközelítés különlegesen fontos az olyan daganattípusoknál, amelyekre eddig nem létezik célzott terápia, ezért kutatásaink fókuszpontjában ezek állnak.
Munkatársak
Munkatársaink tapasztalt vegyészek, biológusok és biokémikusok, akik együtt dolgoznak multidiszciplináris projekteken.

• Prof. Dr. Nagy Péter
tudományos igazgató
tudományos osztályvezető
Elérhetőség:
peter.nagy@oncol.hu
(1)-224-8600 / 1170 vagy 3644
Önéletrajz
• Lénárt Zsuzsanna
adminisztrátor
lenart.zsuzsa@oncol.hu
(1)-224-8600 / 2170
• Dr. Erdélyi Katalin
biológus
• Dr. Kotlán Beatrix
biológus
• Dr. Dóka Éva
vegyész
• Ditrói Tamás
vegyész
• Czikora Ágnes
biológus
• Garai Dorottya
biológus, PhD hallgató
• Galambos Klaudia
Biológia MSc hallgató, ELTE
• Balog Noémi
vezető laboratóriumi asszisztens
(1)-224-8600 / 1180
• Nagy Attila
vegyésztechnikus
Legutóbbi dolgozataink
* Levelező szerző
Tamás Ditrói, Attila Nagy, Diego Martinelli, András Rosta, Viktor Kožich, Péter Nagy*
Comprehensive analysis of how experimental parameters affect H2S measurements by the monobromobimane method
Free Radical Biology and Medicine (2019) 136, 146-158. PubMed Link
John L. Wallace, Péter Nagy, Troy D. Feener, Thibault Allain, Tamás Ditrói, David J. Vaughan, Marcelo N. Muscara, Gilberto de Nucci & Andre G. Buret
A Proof-of-Concept, Phase 2 Clinical Trial of the Gastrointestinal Safety of a Hydrogen Sulfide-Releasing Anti-Inflammatory Drug
British Journal of Pharmacology (2019) Epub ahead of print PubMed Link
Katalin Éva Sikura, Tamás Szerafin, László Potor, Melinda Oros, Péter Nagy, Gábor Méhes, Zoltán Hendrik, Abolfazl Zarjou, Anupam Agarwal, Niké Posta, Roberta Torregrossa, Matthew Whiteman, György Balla, József Balla
Hydrogen sulfide abrogate heart valve calcification: implications for calcific aortic valve disease
British Journal of Pharmacology (2019) Epub ahead of print PubMed Link
Joseph Lin, Masahiro Akiyama, Iris Bica, Faith T. Long, Catherine F. Henderson, Robert N. Goddu, Valeria Suarez, Blaine Baker, Tomoaki Ida, Yasuhiro Shinkai, Péter Nagy, Takaaki Akaike, Jon M. Fukuto, and Yoshito Kumagai
The Uptake and Release of Polysulfur Cysteine Species by Cells: Physiological and Toxicological Implications
Chemical Research in Toxicology (2019) 32, 447-455. PubMed Link
Hisyam Abdul Hamid, Akira Tanaka, Tomoaki Ida, Akira Nishimura, Tetsuro Matsunaga, Shigemoto Fujii, Masanobu Morita, Tomohiro Sawa, Jon M. Fukuto, Péter Nagy, Ryouhei Tsutsumi, Hozumi Motohashi, Hideshi Ihara, and Takaaki Akaike
Polysulfide stabilization by tyrosine and hydroxyphenyl-containing derivatives that is important for a reactive sulfur metabolomics analysis
Redox Biology (2019) 21, 101096. PubMed Link
Péter Nagy*, Günter Schwarz and Stanislav Kopriva
Highlighted mechanistic aspects in the chemical biology of reactive sulfur species
British Journal of Pharmacology (2019) 176, 511-513. PubMed Link
Virág Bogdándi, Tomoaki Ida, Thomas R Sutton, Christopher Bianco, Tamás Ditrói, Grielof Koster, Hillary A Henthorn, Magda Minnion, John P Toscano, Albert van der Vliet, Michael D Pluth, Martin Feelisch, Jon M Fukuto, Takaaki Akaike and Péter Nagy*
Speciation of Reactive Sulfur Species and their Reactions with Alkylating Agents: Do we have any clue about what is present inside the cell?
British Journal of Pharmacology (2019) 176, 646-670. PubMed Link
Christopher L. Bianco, Takaaki Akaike, Tomoaki Ida, Péter Nagy, John P. Toscano, Yoshito Kumagai, Catherine F. Henderson, Robert N. Goddu, Joseph Lin and Jon M. Fukuto
The Reaction of Hydrogen Sulfide with Disulfides: Formation of a Stable Trisulfide and Implications to Biological Systems
British Journal of Pharmacology (2019) 176, 671-683. PubMed Link
Viktor Kozich, Tamás Ditrói, Jitka Sokolová, Michaela Křížková, Jakub Krijt, Pavel Ješina, Péter Nagy*
Metabolism of sulfur compounds in homocystinurias
British Journal of Pharmacology (2019) 176, 594-606. PubMed Link
Anke Wind, Joris van Dijk, Isabelle Nefkens, Wineke van Lent, Péter Nagy, Ernestas Janulionis, Tuula Helander, Francisco Rocha-Goncalves and Wim van Harten
Development of a benchmark tool for cancer centers; results from a pilot exercise
BMC Health Services Research (2018) 18:764. PubMed Link
Jon M. Fukuto, Louis J. Ignarro, Péter Nagy, David A. Wink, Christopher G. Kevil, Martin Feelisch, Miriam M. Cortese‐Krott, Christopher L. Bianco, Yoshito Kumagai, Adrian J. Hobbs, Joseph Lin, Tomoaki Ida, Takaaki Akaike
Biological Hydropersulfides and Related Polysulfides: A New Concept and Perspective in Redox Biology
FEBS Letters (2018) 592(12), 2140-2152 PubMed Link
László Potor, Péter Nagy, Gábor Méhes, Zoltán Hendrik, Viktória Jeney, Dávid Pethő, Anita Vasas, Zoltán Pálinkás, Enikő Balogh, Ágnes Gyetvai, Matthew Whiteman, Roberta Torregrossa, Mark E. Wood, Sándor Olvasztó, Péter Nagy, György Balla, József Balla
Hydrogen Sulfide Abrogates Hemoglobin-Lipid Interaction In Atherosclerotic Lesion
Oxidative Medicine and Cellular Longevity (2018) Volume 2018 PubMed Link
David E. Heppner, Milena Hristova, Tomoaki Ida, Ana Mijuskovic, Christopher M. Dustin, Virág Bogdándi, Jon M. Fukuto, Tobias P. Dick, Péter Nagy, Jianing Li, Takaaki Akaike, Albertvan der Vliet
Cysteine perthiosulfenic acid (Cys-SSOH): A novel intermediate in thiol-based redox signaling?
Redox Biology (2018) 14, 379-385. PubMed Link
Gábor Rubovszky, Barna Budai, Erna Ganofszky, Zsolt Horváth, Éva Juhos, Balázs Madaras ,Tünde Nagy, Eszter Szabó, Tamás Pintér, Erika Tóth, Péter Nagy, István Láng, Erika Hitre
Predictive Value of Early Skin Rash in Cetuximab-Based Therapy of Advanced Biliary Tract Cancer
Pathology & Oncology Research (2018) 24(2), 237-244. PubMed Link
Dorottya Garai, Zoltán Pálinkás, József Balla, Anthony J. Kettle, Péter Nagy*
Measurements for sulfide-mediated inhibition of myeloperoxidase activity
Methods in Molecular Biology Beltowski J, editor Springer, in press; 2017.
Éva Dóka, Elias S. J. Arnér, Edward E. Schmidt, Péter Nagy*.
ProPerDP, a Protein Persulfide Detection Protocol
Methods in Molecular Biology Beltowski J, editor Springer, in press; 2017.
Christopher Kevil, Miriam M. Cortese-Krott, Péter Nagy, Martin Feelisch, Csaba Szabó
Cooperative interactions between NO and H2S: chemistry, biology, physiology, pathophysiology
Nitric Oxide Biology and Pathobiology 3rd Edition Ignarro L.J., Ed. Elsevier: (2017) 57-83 Invited chapter.
Dorottya Garai, Bessie B. Ríos-González, Paul G. Furtmüller, Jon M. Fukuto, Ming Xian,
Juan López-Garriga, Christian C. Obinger, Péter Nagy*
Mechanisms of myeloperoxidase catalyzed oxidation of H2S by H2O2 or O2 to produce potent protein Cys-polysulfide-inducing species
Free Radical Biology and Medicine (2017) 113, 551–563. PubMed Link
Takaaki Akaike, Tomoaki Ida, Fan-Yan Wei, Motohiro Nishida, Yoshito Kumagai, Md. Morshedul Alam, Hideshi Ihara, Tomohiro Sawa, Tetsuro Matsunaga1, Shingo Kasamatsu, Akiyuki Nishimura, Masanobu Morita, Kazuhito Tomizawa, Akira Nishimura, Satoshi Watanabe, Kenji Inaba, Hiroshi Shima, Nobuhiro Tanuma, Minkyung Jung, Shigemoto Fujii, Yasuo Watanabe, Masaki Ohmuraya, Péter Nagy, Martin Feelisch, Jon M. Fukuto & Hozumi Motohashi
Cysteinyl-tRNA synthetase governs cysteine polysulfidation and mitochondrial bioenergetics
Nature Communications (2017) 8(1), 1177 PubMed Link
Miriam Margherita Cortese-Krott, Anne Koning, Gunter Georg Kuhnle, Péter Nagy, Christopher Bianco, Andreas Pasch, David A Wink, Jon Fukuto, Alan A Jackson, Harry van Goor, Kenneth R Olson, Martin Feelisch
The Reactive Species Interactome: Evolutionary Emergence, Biological Significance, and Opportunities for Redox Metabolomics and Personalized Medicine
Antioxidants and Redox Signaling (2017) 27(10), 684-712. PubMed Link
Bartosz Szczesny, Michela Marcatti, John R. Zatarain, Nadiya Druzhyna, John E. Wiktorowicz, Péter Nagy, Mark R. Hellmich & Csaba Szabó
Inhibition of hydrogen sulfide biosynthesis sensitizes lung adenocarcinoma to chemotherapeutic drugs by inhibiting mitochondrial DNA repair and suppressing cellular bioenergetics
Scientific Reports (2016) 6, 36125. PubMed Link
Gábor Sirokmány, Anna Pató, Melinda Zana, Ágnes Donkó, Adrienn Bíró, Péter Nagy, Miklós Geiszt
Epidermal growth factor-induced hydrogen peroxide production is mediated by dual oxidase 1
Free Radical Biology and Medicine (2016) 97, 204-211 PubMed Link
Éva Dóka, Irina Pader, Adrienn Bíró, Katarina Johansson, Qing Cheng, Krisztina Ballagó, Justin R. Prigge, Daniel Pastor-Flores, Tobias P. Dick, Edward E. Schmidt, Elias S. J. Arnér and Péter Nagy*
Novel persulfide detection method reveals protein persulfide and polysulfide reducing functions of thioredoxin- and glutathione-systems
Science Advances (2016) 2(1):e1500968. PubMed Link
Tamás Baranyai, Kata Herczeg, Zsófia Onódi, István Voszka, Károly Módos, Nikolett Marton, György Nagy, Imre Mäger, Matthew J Wood, Samir El Andaloussi, Zoltán Pálinkás, Vikas Kumar, Péter Nagy, Ágnes Kittel, Edit Irén Buzás, Péter Ferdinandy, Zoltán Giricz
Isolation of exosomes from blood plasma: qualitative and quantitative comparison of ultracentrifugation and size exclusion chromatography methods
PLoS One (2015) 10(12):e0145686. PubMed Link
Miriam M Cortese-Krott, Gunter GC Kuhnle, Alex Dyson, Bernadette O Fernandez, Marian Grman, Jenna F DuMond, Mark P Barrow, George McLeod, Hidehiko Nakagawa, Karol Ondrias, Péter Nagy, S Bruce King, Joseph E Saavedra, Larry K Keefer, Mervyn Singer, Malte Kelm, Anthony R Butler, Martin Feelisch
Key bioactive reaction products of the NO/H2S interaction are S/N-hybrid species, polysulfides, and nitroxyl
Proceedings of the National Academy of Sciences (2015) 112(34):E4651-60. PubMed Link
Andrea Berenyiova, Marian Grman, Ana Mijuskovic, Andrej Stasko, Anton Misak, Péter Nagy, Elena Ondriasova, Sona Cacanyiova, Vlasta Brezova, Martin Feelisch, Karol Ondrias
The reaction products of sulfide and S-nitrosoglutathione are potent vasorelaxants
Nitric Oxide (2015) 46:123-30. PubMed Link
Anita Vasas, Éva Dóka, István Fábián, Péter Nagy*
Kinetic and thermodynamic studies on the disulfide-bond reducing potential of hydrogen sulfide
Nitric Oxide (2015) 46:93-101. PubMed Link
Zoltán Pálinkás, Paul G Furtmüller, Attila Nagy, Christa Jakopitsch, Katharina F Pirker, Marcin Magierowski, Katarzyna Jasnos, John L Wallace, Christian Obinger, Péter Nagy*
Interactions of hydrogen sulfide with myeloperoxidase
British Journal of Pharmacology (2015) 172(6):1516-32. PubMed Link
David Peralta, Agnieszka K Bronowska, Bruce Morgan, Éva Dóka, Koen Van Laer, Péter Nagy, Frauke Gräter, Tobias P Dick
A proton relay enhances H2O2 sensitivity of GAPDH to facilitate metabolic adaptation
Nature Chemical Biology (2015) 11(2):156-63. PubMed Link
Péter Nagy*
Mechanistic chemical perspective of hydrogen sulfide signaling
Methods in Enzymology (2015) 554:3-29. PubMed Link
J Xu, SE Eriksson, M Cebula, T Sandalova, E Hedström, I Pader, Q Cheng, CR Myers, WE Antholine, P Nagy, Ulf Hellman, G Selivanova, Y Lindqvist, ESJ Arnér
The conserved Trp114 residue of thioredoxin reductase 1 has a redox sensor-like function triggering oligomerization and crosslinking upon oxidative stress related to cell death
Cell Death & Disease (2015) 6:e1616. PubMed Link
Meghívott előadások
Előadó: Prof. Dr. Nagy Péter
2020 Meghívott előadó Gordon Research Conference on Thiol-Based Redox Regulation & Signaling, Castelldefels, Spanyolország
2019 Meghívott előadó - Persulfide Conference 2019, Sendai, Japán
2019 Control of Protein Function Through Oxidation and Reduction of Persulfidated States
Meghívott előadó - Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Tohoku University, Sendai, Japán
2019 Redox-tumorbiology; an emerging field in cancer research
Előadő - I. Regionális Onkológiai Együttműködési és Partnerségi Konferencia, Budapest, Magyarország
2018 Speciation of reactive sulfur species: Do we have any clue about what’s inside the cell?
Meghívott előadó - 4th meeting of the study group for redox biology of the German Society for Molecular Biology and Biochemistry, Berlin, Németország
2018 Speciation of reactive sulfur species: do we have any clue about what’s inside the cell?
Meghívott előadó - Thiol-Based Redox Regulation and Signaling (Gordon Research Conference), Spanyolország
2018 Reactive sulfur species: mechanistic considerations for their regulatory functions in redox biology
Meghívott előadó és szekcióelnök/szervező - Redox Biology section; 2018 FEBS conference, Prága, Csehország
2018 Dynamic redox cycling of hydrogen sulfide and polysulfide species could represent an important regulatory element in sulfur biology
Meghívott előadó és szekcióelnök/szervező - 2018 SFRRI, Lisszabon, Portugália
2018 Speciation of reactive sulfur species: do we have any clue about what’s inside the cell?
Meghívott előadó és a tudományos bizottság tagja - 5th World Congress on Hydrogen Sulfide in Biology and Medicine, Toronto, Kanada
2017 Dynamic redox cycling of hydrogen sulfide and polysulfide species could represent an important regulatory element in sulfur biology
Meghívott előadó és szervező - Plant and Human Sulfur Biology Conference 2017, Balatonfüred, Magyarország
2017 Roles of the thioredoxin and glutathione systems in reduction of inorganic- and Cys-polysulfide species
Meghívott előadó - Se2017: The 11th Intenational Symposium on Selenium in Biology and Medicine and The 5th International Conference on Selenium in the environment and Human health, Stockholm, Svédország
2017 Hydrogen Sulfide Signaling
Meghívott előadó - Redox regulation, oxidative stress and selenoproteins - Summer Graduate Course, Karolinska Institutet, Stockholm, Svédország
2017 Molecular models of hydrogen sulfide-mediated protection against oxidative stress
Meghívott előadó - 90th Annual Meeting of Japanese Society for Bacteriology, Sendai, Japán
2016 Some aspects of sulfur biology from a mechanistic chemist's perspective
Meghívott előadó - Center for Molecular Medicine Cologne University, Köln, Németország
2016 Chemical aspects of sulfane sulfur biology
Meghívott előadó - Tohoku University Graduate School of Medicine, Sendai, Japán
2016 Advances and challenges in the field of H2S biology
Meghívott előadó - Dojindo Inc. HQs in Kumamoto, Japán
2016 Bio-chemical aspects of thiol oxidation
Meghívott szeminárium - Kyoto University, Kyoto, Japán
2016 Molecular pathways in persulfide biology
Meghívott előadó - 9th International Conference on the Biology, Chemistry, and Therapeutic Applications of Nitric Oxide held jointly with the 16th Annual Scientific Meeting of the Nitric Oxide Society of Japan, Sendai, Japán
2016 Hydrogen sulfide, the new kid on the block in redox signaling
Meghívott előadó - Society for Free Radical Research-Europe, Budapest, Magyarország
2016 Insights into the molecular pathways of persulfide-mediated redox signaling
Meghívott előadó - 4th International Conference on the Biology of Hydrogen Sulfide, Nápoly, Olaszország
2015 Protein persulfides: Insights into the molecular mechanisms of H2S signaling
Meghívott plenáris előadó - Joint Meeting of the Societies for Free Radical Research Australasia and Japan, Christchurch, Új Zéland
2015 Mechanistic chemical perspective of thiol redox biology
Meghívott előadó - Thiol-based redox switches in life sciences ESF-EMBO conference, San Feliu de Guixols, Spanyolország
2015 Superoxide-mediated post-translational modification of tyrosine resideues
Meghívott előadó - Society for Free Radical Research- Europe meeting Stuttgart, Németország
2015 Hydrogen sulfide and redox signaling
Meghívott előadó - “Redox Regulation, Oxidative Stress, and Selenoproteins.” Medical University of South Carolina in Charleston, S.C., USA
2015 Mechanistic Chemical Perspective of Hydrogen Sulfide Signaling
Meghívott előadó - 3rd European Conference on the Biology of Hydrogen Sulfid, Athén, Görögország
2015 Mechanistic Chemical Perspective of Hydrogen Sulfide Signaling
Meghívott előadó - „RISE Enhancing Biomedical Sciences and Biomedical Engineering in Science and Technology”Mayagüez, Puerto Rico
2015 Redox biochemistry of thiol proteins and hydrogen sulfide
Meghívott szeminárium - LSU Health Shreveport, LA, USA
Aktuális pályázatok
- 2019 NKFIH Tématerületi Kiválósági Program „Az emlőrákok innovatív onkológiai kezelése” Vezető kutató: Prof. Dr. Nagy Péter
- 2018-2022 NKFIH K129286, „A kénhidrogén védő szerepe MPO-ANCA asszociált vaszkulitiszben” Vezető kutató: Prof. Dr. Nagy Péter
- 2017-2019 NKFIH K 26766 (A jelentős nemzetközi hatású, kiemelkedő eredményeket elért kutatócsoportok támogatása), „A tioredoxin és glutation rendszerek és a CARS2 rendszer együttműködése a fehérje poliszulfidáció szabályozásában” Vezető kutató: Prof. Dr. Nagy Péter
- 2013-2017 OTKA K109843, „Peroxiredoxin fehérjék peroxidáz funkciójának szerepe rákos megbetegedések vonatkozásában” Vezető kutató: Prof. Dr. Nagy Péter
- 2016-2018 NIH 1R21AG055022-01, ’Redox regulation in the hepatostat’
Vezető kutató: Prof. Edward E. Schmidt, Társkutatók: Prof. Elias S.J. Arnér, Prof. Dr. Nagy Péter
Oktatás
- Egyetemi kurzus:
- “Redox-kémia biológiai rendszerekben”
- “Redox-biokémia. Reaktív Oxigén Származékok (ROS) képződése és szerepe biológiai rendszerekben.” Prof. Dr. Nagy Péter, Dr. Dóka Éva, Ditrói Tamás, Debreceni Egyetem, Kémiai Intézet
- „Redox Biokémia” Prof. Dr. Nagy Péter, Dr. Dóka Éva, Ditrói Tamás, Dr. Erdélyi Katalin – Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet
- PhD képzés
- “A kénhidrogén és metabolitjainak szerepe a neutrofil fagociták funkciójában és redox jelátviteli folyamatokban.” Debreceni Egyetem, PhD diák: Vasas Anita, Témavezető: Nagy Péter - Sikeresen fokozatot szerzett (Summa Cum Laude minősítéssel)
- „Kénhidrogén által vezérelt jelátviteli folyamatok molekuláris mechanizmusai” Pécsi Tudományegyetem, PhD diák: Bogdándi Virág, Témavezető: Nagy Péter
- „A kénhidrogén szerepe neutrofil granulociták által vezérelt gyulladásos folyamatokban.” Debreceni Egyetem, PhD diák: Garai Dorottya, Témavezető: Nagy Péter
-
- Prof. Dr. Nagy Péter – Visiting professor, Semmelweis Egyetem
- Nemzetközi Kémiai Diákolimpia felkészítő és válogató kurzus
Főbb Hazai és Nemzetközi együttműködő partnereink
- Prof. Takaaki Akaike, Tohoku University Graduate School of Medicine, Sendai, Japán
- Prof. Elias Arnér, Karolinska Institutet, Stockholm, Svédország
- Prof. Balla József, Debreceni Egyetem, Nephrológiai Tanszék
- Prof. Tobias Dick DKFZ, Heidelberg, Németország
- Prof. Geiszt Miklós, Semmelweis Egyetem, Élettani Intézet
- Prof. Martin Feelisch, Southampton University, Southampton, Egyesült Királyság
- Prof. Jon Fukuto, Department of Chemistry, Sonoma State University, Sonoma, California, USA
- Prof. Viktor Kožich, General University Hospital in Prague, Csehország
- Prof. Janne Lehtiö, Dept. of Onco-Pathology and Proteomics facility at the SciLifeLab, Stockholm, Svédország
- Prof. Juan Lopez Garriga, Recinto Universitario de Mayagüez, Mayagüez, Puerto Rico
- Prof. Ed Schmidt, Dept. of Microbiology and Immunology, Montana State University, Montana, USA
- Prof. John L. Wallace, Department of Physiology and Pharmacology, University of Calgary, Calgary, Kanada; Antibe Therapeutics, Toronto, Kanada
- Prof. Christine Winterbourn, University of Otago Christchurch, Centre for Free Radical Research, Christchurch, Új-Zéland
Alkalmazott technikák és műszerek
Metabolomikai és proteomikai platform
Enzimaktivitás, metabolitok, reaktív kénszármazékok meghatározása tömegspektrometria és folyadékkromatográfia segítségével
- Thermo LTQ XL tömegspektrométer
- EASY-nLC II nano HPLC
- Thermo Scientific UltiMate 3000 HPLC fluoreszcens detektorral
Sejt- és szövettenyésztés
Daganatos humán sejtvonalak tenyésztése és vizsgálata – emlő, tüdő, pankreász és melanoma
Xenograft modellek készítése immunhiányos egérmodellekben
Vérmintákból izolált neutrofil granulociták vizsgálata
Egér szövetminták feldolgozása metabolomikai és proteomikai célra
- steril sejttenyésztő fülkék, inkubátor, hypoxiás berendezés, fluoreszcens és fénymikroszkóp, termosztálható vízfürdő, szonikátor, centrifugák
- szövetfestési eljárások
- Braun Mikro-Dismembrator II szövet homogenizátor
Molekuláris biológiai módszerek
Génexpresszió csendesítése lentivírus technikával és CRISPR módszerrel
Emlős sejtvonalak tranziens és stabil transzfekciója
Plazmid konstrukciók tervezése és szaporítása
- baktérium tenyésztésre alkalmas rázógép
- PCR készülék
- agaróz gélelektroforézis készülék DNS és RNS elválasztásához
SDS-PAGE és Western blot technikák
izolált fehérjék és sejt- illetve szövetlizátumok vizsgálata immunoblot módszerrel
2D és 2D diagonál gélelektroforézis
- CBS Scientific gélelektroforézis készülék
- BioRad Mini-Protean vizes Western blot készülék
- Kétdimenziós gélelektroforézis felszerelés
- Syngene Gbox géldokumentációs rendszer
- Gélfestési eljárások: Coomassie Brilliant Blue, Ponceau S, ezüstfestés
Enzimkinetikai vizsgálatok
Enzimaktivitás assay-k, UV-látható spektroszkópiai vizsgálatok, oldatfázisú reakciókinetikai és mechanisztikus tanulmányok
- BioTek PowerWave XS spektrofotométer és mikroplate olvasó
- Agilent Cary 8454 diódasoros UV-látható spektrofotométer
- Tecan Spark 10M multimode mikroplate olvasó – fluoreszcencia, abszorbancia és lumineszcencia követésére, beépített élő sejtek vizsgálatára alkalmas modullal
Saját és kollaborációs fejlesztésű módszerek
- ProPerDP – Protein Persulfide Detection Protocol
Fehérje perszulfidáció detektálására alkalmas kísérleti eljárás, amely izolált fehérjéken, intakt sejteken és szövetmintákon egyaránt alkalmazható
Doka et al., Science Advances (2016) 2(1):e1500968. PubMed Link
Doka et al., In: Bełtowski J. (eds) Vascular Effects of Hydrogen Sulfide. Methods in Molecular Biology, vol 2007. Humana, New York, NY (2019) 51-77
- Kis molekulatömegű és fehérje eredetű perszulfid és reaktív kénszármazékok tömegspektrometriás meghatározása HPE-IAM-os jelölést és alkalmas emésztést követően
Hamid et al., Redox Biology (2019) 21, 101096. PubMed Link
Akaike et al., Nature Communications (2017) 8(1), 1177 PubMed Link
- Hidrogén-szulfid meghatározása biológiai mintákból monobromobimános jelölést követően
- Ditroi et al., (2019) 136, 146-158. PubMed LinkMetabolomika
Transszulfurációs útvonalak metabolomjainak meghatározása nagy érzékenységű tömegspektrometriai módszerekkel
- CBS (cisztationin béta-szintáz) enzimaktivitás meghatározása vérplazmából
Krijt et al., Journal of Inherited Metabolic Disease, (2011) 34(1):49-55. PubMed Link
- MPO peroxidáz aktivitásának fluoreszcenciás meghatározása aktivált neutrofilek sejtfelülúszójából
Palinkas et al., British Journal of Pharmacology (2015) 172(6):1516-32. PubMed Link
Garai et al In: Bełtowski J. (eds) Vascular Effects of Hydrogen Sulfide. Methods in Molecular Biology, vol 2007. Humana, New York, NY (2019) 179-203.
- MPO poliszulfid termelő kapacitásának meghatározása fluoreszcenciásan
Garai et al., Free Radical Biology and Medicine (2017) 113, 551–563. PubMed Link
Linkek
- 6th World Congress on Hydrogen Sulfide in Biology & Medicine
- Innotéka magazin – Kutatói portré: Dr. Nagy Péter
http://www.innoteka.hu/cikk/vilagbajnok_csapat_elen.1605.html
- Sajtóközlemények
http://informed.hu/betegsegek/betegsegek_reszletesen/cancer/?article_hid=204591
http://daganatok.hu/rakkutatas/uj-onkolgiai-terapias-utakat-nyithat-a-kenhidrogen